З 1 червня 2007 року в Лабораторії розроблена і функціонує система управління якістю, та запроваджений процесний підхід згідно вимог ДСТУ EN ISO 9001 "Системи управління якістю. Вимоги".

Система управління якістю Державної науково-дослідної лабораторії з контролю якості лікарських засобів державної установи "Інститут громадського здоров'я ім. О.М. Марзєєва Національної академії медичних наук України» сертифікована ТОВ "Український інститут стандартів" на відповідність вимогам ДСТУ EN ISO 9001:2018, Сертифікат відповідності № Q1S 804 308 C1 від 22.08.2024 р.

У Лабораторії розроблений пакет документів згідно вимог ДСТУ EN ISO 9001:2018, а саме:

- політика в області якості,

- цілі Лабораторії,

- настанова з якості,

- паспорт Лабораторії,

- положення про лабораторію,

- процедури з якості,

- стандартні операційні процедури,

- інші документи.